Tobias Pelkner studierte bei Alfred Rinderspacher an der Hochschule für Musik Mannheim und bei Klaus Thunemann an der Hochschule für Musik Hannover. 
1992 gewann er mit dem Diaphonia Quintett den Preis des Deutschen Musikwettbewerbs, worauf zahlreiche Tourneen, u. a. nach Spanien, England, Irland und in die Ukraine, sowie Rundfunkaufnahmen und Auftritte bei renommierten Festivals wie dem Rheingau Musikfestival, dem Mozartfest in Würzburg oder dem Schleswig-Holstein Musik Festival folgten.

Von 1995 bis 2010 war er 1. Solo-Fagottist der Staatsoper Stuttgart. In der gleichen Position spielte er außerdem als Gast in zahlreichen großen deutschen Sinfonieorchestern wie dem Radiosinfonieorchester des SWR Stuttgart, dem WDR Sinfonieorchester und an großen Opernhäusern, u. a. an der Bayerischen Staatsoper München, an der Hamburger Staatsoper, beim Gürzenich-Orchester Köln sowie bei den Rundfunkorchestern des SWR, WDR, NDR und SR. Er ist zudem seit 2016 Solofagottist im Festspielorchester der Bayreuther Festspiele.

Im Jahr 2007 erhielt Tobias Pelkner nach langjähriger privater Unterrichtstätigkeit den Ruf als Professor für Fagott an die Hochschule für Musik Hamburg. Seit 2009 ist Tobias Pelkner Professor an der Hochschule für Musik Detmold und leitet dort eine überaus erfolgreiche Klasse mit über 200 erfolgreich absolvierten Probespielen seiner Studierenden, sowohl national als auch international.

(Foto: privat)